作者：冯丽苹 张洪亮 彭金美 刘春晓 王倩 李真 ...猪瘟病毒分子特征
摘要：为研究猪瘟病毒（CSFV）2．1d新基因亚型的基因组特征，本研究根据GenBank中登录的zj0801株CSFV全基因组序列设计合成6对引物，通过RT-PCR方法对2014年分离自山东的两株2．1d亚型CSFV（SDSGl410和SDLSl410）进行全基因组测序，两株CSFV全长均为12296nt。全基因组遗传演化分析表明这两个分离株位于一个独立分支中，属于2．1d亚型，与E2基因分型结果一致。核苷酸和推导氨基酸同源性分析显示，分离株全基因组同源性与参考株相比差异较大，与zi0801株的全基因组同源性最高为97．3％～97．5％，而与1．1亚型的Shimen和HCLV株的同源性仅为85．0％～85．1％和84．3％～84．4％；部分基因和非翻译区变异较大，如Npro、C、E2、NS2、NS5A和3＇UTR。对全基因组氨基酸序列分析，结果显示2．1d亚型CSFV在V640、K992、A1020、Mt090、R1395和D2374 6处氨基酸上具有共同的分子特征。以上研究结果增加了CSFV2．1d新基因亚型的分型依据。
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